Reproduire les calculs des exemples de viability-theory.org

Reproduire les calculs des exemples de viability-theory.org :

Aller sur la page du cas d'usage choisi, par exemple l'exemple de Julia, et télécharger les deux fichiers .h et .json associés à l'implémentation dans Viablab.

Copier le fichier .json dans le répertoire ~/ViabLabGui/bin/VIABLAB/INPUT et le fichier .h dans le répertoire  ~/ViabLabGui/bin/VIABLAB/source/data/ 

Editer le fichier ~/ViabLabGui/bin/VIABLAB/source/data/ModelDataInclusion.h

Remplacer la ligne qui commence par string paramsFile avec le nom du fichier .json que vous venez de copier. Par exemple, si ce fichier s'appelle toto.json, il faut écrire écrire :

string paramsFile = "toto.json";

Remplacer dans la ligne qui commence par #include, le nom du fichier .h par celui du fichier que vous venez de copier : si ce fichier se nomme data_toto.h, écrire

#include  "../data//data_toto.h"

Enregistrer le fichier ModelDataInclusion.h

Retourner dans le répertoire ~/ViabLabGui/bin/VIABLAB/build :

Pour Linux : 

make

pour créer le fichier exécutable viabLabExe, puis, pour l'exécuter :

./viabLabExe

Pour MacOS : 

Générer avec make (en utilisant tous les CPU du Mac pour accélérer la compilation)

make -j$(sysctl -n hw.logicalcpu)

Pour exécuter viabLabExe

 ./viabLabExe 

Vous venez de lancer le calcul de noyau de viabilité identique à celui du site !